Natural da Póvoa de Lanhoso, José Miguel Freitas licenciou-se pela Escola Superior de Música de Lisboa, com Pedro Saglimbeni Muñoz, e tornou-se mestre com grootste onderschreiding (grande distinção) pelo Conservatório Real de Antuérpia, com Leo de Neve, enquanto bolseiro da Fundação Gulbenkian, e pelo Royal College of Music de Londres, com Nathan Braude, como bolseiro The Houston Family Scholar supported by a Lucy Ann Jones Scholarship.
Laureado em duas edições do Concurso Nacional de Cordas Vasco Barbosa, participou em masterclasses com Igor Suliga, Máté Szücs, Isabel Charisius, Maxim Rysanov, Antonello Farulli e Andriy Viytovych. Foi academista da Orquestra Sinfónica de Antuérpia na temporada 2019/2020, orquestra com a qual mantém atividade regular de reforço até ao presente, e membro da Orquestra de Câmara da Bélgica – Casco Phil, entre 2021 e 2024. Colabora frequentemente com a Orquestra Filarmónica de Bruxelas desde 2021.
Concluídos os estudos, embarcou numa jornada de quatro anos no Projeto Quíron, quarteto de cordas do qual é membro fundador e com o qual se tem apresentado em salas e festivais por toda a Europa Ocidental e Central. Desenvolvendo uma formação intensa com orientação do Quarteto Danel (Academia de Quartetos de Cordas da Holanda – NSKA) desde a sua criação, destaca-se o prémio alcançado no Concurso Internacional de Música Karol Szymanowski (2023, Polónia). Com o Quarteto Quíron, desenvolveu contacto com grandes músicos e pedagogos, entre os quais Eberhard Feltz, Mathieu Herzog, Pierre Colombet, Szymon Krzeszowiec, Clive Brown, William Coleman, Guy Danel, Joseph Kluson, para lá dos quartetos Van Kuijk, Jerusalem, Bennewitz e Prazak. Partilhou o palco com os Quartetos Danel e Jerusalém, Svetlin Roussef, Jennifer Stumm, Johanns Thorsten, Emil Rovner, Guy Danel e Joseph Kluson.
Apresentou-se em concertos de câmara com o Trio Fidelio (Reino Unido), com os Ensembles RARO e Ataneres (Bélgica), com Jean-Louis Rassinfosse e Jean-Phillippe Collard-Neven (Bélgica), com os Solistas da Orquestra XXI (Portugal) e com Marc Danel no Tivoli Vredenburg (Holanda). É membro do ensemble Karavan Vivaldi, de Lorenzo Gatto, desde a sua criação, em 2022.
José Freitas toca uma viola Stephan Jarosz de 2017.