Nascido em Arrentela (1986), concelho de Seixal, inicia a sua aprendizagem em percussão na Escola de Música da Sociedade Filarmónica União Arrentelense. Prossegue os estudos musicais na Escola Profissional de Música e Artes de Almada, na Escola Artística de Música do Conservatório Nacional e na Escola Superior de Música de Lisboa. É licenciado pela Universidade de Évora, na classe do prof. Dr. Eduardo Lopes; mestre em música e ensino da música pela Escola Superior de Música de Lisboa, sob a orientação dos professores Pedro Carneiro e Richard Buckley; e frequenta atualmente o programa de doutoramento em música e musicologia da Universidade de Évora.
É um dos percussionistas portugueses mais ativos e versáteis da sua geração, focando-se particularmente no repertório de música de câmara. Colabora regularmente com as seguintes formações: Orquestra Gulbenkian, Orquestra Metropolitana de Lisboa, Orquestra Sinfónica Portuguesa, Orquestra Nacional do Porto, Orquestra Sinfonietta de Lisboa, Orquestra de Câmara Portuguesa, Lisbon Film Orchestra, Ensemble D’Arcos, Ensemble Mediterrain, Lisbon Ensemble 20/21, Lusitanus Ensemble, Quarteto Lopes-Graça, Quarteto Artemsax, Brass Factory, New Music Collective, entre outros.
Enquanto solista apresentou-se com a Banda Sinfónica da Polícia de Segurança Pública e com a Banda de Música da Força Aérea Portuguesa, entre outros agrupamentos. Das diversas obras que lhe foram dedicadas, destacam-se ‘Gamala’ concerto para percussão e orquestra de sopros de Lino Guerreiro (2012) e Concerto para Beleza e Vibrafone de Jorge Salgueiro (2015).
É atualmente professor coordenador na Metropolitana (Academia Superior de Orquestra, Escola Profissional Metropolitana, Conservatório de Música da Metropolitana), professor assistente convidado no Departamento de Música da Escola d’Artes da Universidade de Évora e professor da Escola Artística de Música do Conservatório Nacional. É também diretor artístico do grupo de percussão “Percussões da Metropolitana” e presidente do júri do Concurso Internacional de Percussão da Beira Interior.
Marco Fernandes toca exclusivamente com baquetas e instrumentos das marcas: Innovative Percussion Inc., Majestic Percussion e Zildjian Company.